Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms