Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTDSS2Q9BVG9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms