Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB2BQ9BVA1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms