Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C2orf88Q9BSF0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms