Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MESP1Q9BRJ9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms