Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 FCRLA-205ENST00000350710 1639 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD2-212ENST00000627622 1740 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN1P35-201ENST00000303758 594 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4E2-204ENST00000409322 797 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF9-203ENST00000425452 640 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01914-201ENST00000427054 640 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRM3-AS1-201ENST00000444721 486 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512594.1-201ENST00000447378 1012 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00445-202ENST00000456848 643 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC120036.1-201ENST00000479243 654 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02082-201ENST00000484765 710 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TPM3P9-202ENST00000492121 745 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00290-201ENST00000512487 593 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023794.3-201ENST00000514503 564 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TCEA1-204ENST00000518784 586 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB2A-208ENST00000529579 680 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 RASSF8-AS1-204ENST00000535436 1121 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068768.1-202ENST00000541002 1110 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001180.5-201ENST00000581948 730 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243960.3-201ENST00000599316 580 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245297.3-201ENST00000611769 838 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.41-201ENST00000614637 258 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001065.3-201ENST00000622854 646 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TRHR-201ENST00000311762 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 MS4A4A-201ENST00000337908 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CTSK-201ENST00000271651 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP4-12Q9BQ66 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms