Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHFRQ96EP1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHFRQ96EP1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms