Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNDC9Q8TBE3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms