Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD1Q8NHV4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms