Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDND2Q8NHS1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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