Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms