Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HJURPQ8NCD3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms