Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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