Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms