Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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USP31Q70CQ4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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USP31Q70CQ4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP31Q70CQ4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP31Q70CQ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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