Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms