Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms