Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms