Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms