Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITRM1Q5JRX3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITRM1Q5JRX3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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