Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF1Q3BBV0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms