Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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