Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CTF1Q16619 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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