Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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