Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUM3Q15397 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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