Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms