Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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