Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms