Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXF1Q12946 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXF1Q12946 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXF1Q12946 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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