Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN2AQ12879 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms