Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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