Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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