Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY1Q0D2K3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms