Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms