Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms