Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIBQ01892 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms