Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDR2Q01850 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms