Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms