Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms