Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELF3P78545 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELF3P78545 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELF3P78545 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms