Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms