Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLDN15P56746 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN15P56746 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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