Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAD23BP54727 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms