Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF6P49848 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF6P49848 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF6P49848 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms