Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPOP42166 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms