Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms