Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms