Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms