Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPHA1P21709 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms