Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms